在专业设置方面，联合学院将更注重交叉学科和新兴领域，将逐步从机械和电子信息领域拓展到其他工程与医学、生命和管理学的交叉领域。2006年首先设置机械类和电气信息类本科专业，招收学生200名。以后发展为每年招收400名本科生、200名硕士研究生、100名博士研究生的规模，并逐步推进自主招生和宽口径、能力型和创新型人才培养的试点。

　　联合学院通过与密歇根大学开展学分互认、学生交换、双学位培养、本硕连读等方式，为学生提供更多国际化培养的计划。学生在联合学院学习两年后可申请赴密歇根大学继续学习，完成双方的学习要求后可获上海交大和密歇根大学的两个学位。在培养计划上，联合学院将全面参考密歇根大学的课程体系，教学模式以英语为主、双语为辅，50%以上核心课程由密歇根大学或国外知名大学教授讲授。密歇根大学常务副校长EdwardM.Gramlich承诺，“让大批密歇根大学教授来交大长期授课并不容易，但我们会尽量多吸引一些教授来交大工作，保证联合学院里一年到头都能有密歇根大学的教授授课。”

　　联合学院还将通过公司合作培养、公司实习等方式来加强课程的实践环节和生产实践环节，培养和提高学生解决实际问题的能力。作为密歇根大学的一个国际化教育基地，每年还将有100——200名密歇根大学的学生在联合学院参加学习。