史贻云指出，由于各省经济发展水平不一，一些落后省份教育经费极为有限，对需要较大投入的高等教育的发展感到力不从心，这些区域的高等教育有可能被边缘化的危险，因此需要中央政府通过转移支付的方式在经费上予以大力支持。目前，随着我国经济总量的持续增加，中央财政有能力满足对高等教育薄弱地区的扶持，关键是要有这方面的统筹考虑，并做出相应的制度安排。

　　史贻云说，近年来随着中央财力的增加，中央在一些高等教育重点项目建设上投资力度较大。如何做到这些重点项目合理布局，使得高等教育资源实现有效的均衡配置是社会较为关心的事。近来中央政府在“211工程”建设方面考虑到了边远落后地区的需求，为少数尚无“211”工程高校的省份留下了发展空间，并采取了一些相应措施，收到了较好效果。他建议，中央政府今后在其它高等教育重大项目建设上做出统筹安排，为落后地区高等教育发展留一席之地。

　　史贻云还建议，改进一些项目评审机制，在立项建设方面给边远落后地区以适当照顾。目前教育部许多项目评审采取“扶优汰弱”的办法，这在一定程度上体现了效率优先。但与此同时，却不利于边远落后地区高等教育的发展，有失教育公平。为体现公平起见，建议教育部各种项目的评审，做到优先保证重点高校的同时，适当兼顾边远、落后地区高校，为这些省份高校设置一定立项指标，保证每个省份在教育部各种项目评审中不落空，以确保弱势省份的基本利益，并发挥这些项目在当地高等教育的示范作用和激励作用。