该院深入探索应用型人才培养思路，不断加强空军高素质军事指挥人才的培养力度。学院通过抓学科建设、队伍建设以及制度建设，不断提高研究生培养质量。学院已形成具有空军特色的军事学科体系，设有军事思想、军事历史、战略、战役等领域的21个学科专业，确立了全脱产入校学习、院校与部队联合培养、进校不离岗位三种研究生培养模式，教学内容努力实现贴近实战、贴近部队、贴近首长机关，采取案例式教学、专题教学、战术课进仿真实验室、参加部队训练演习、开展学术研究等形式。目前，已有800多名军事指挥类博士、硕士从学院毕业，充实到空军部队和机关，成为空军建设和战斗力提升的骨干力量。